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Esta guía es para quien factura desde la pantalla. No hay que programar nada ni instalar nada: alcanza con un navegador.
Si en vez de esto querés que tu sistema emita solo, el camino es otro: está en cómo se arma una integración.

Antes de poder emitir hace falta cargar dos cosas

No es un capricho de Emissa: es lo que ARCA exige para dejarte facturar. El orden importa, porque cada paso necesita el anterior.
Primero se crea el contribuyente, después se le carga la credencial, y recién entonces se puede emitir.

El orden en que se arma todo: sin credencial cargada, el tercer paso no existe.

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Entrar y activar el segundo factor

El panel no se abre sin segundo factor verificado. No es opcional ni se puede posponer: desde adentro se emiten comprobantes fiscales reales, así que la cuenta se protege como se protege un home banking.
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Cargar el contribuyente

En Contribuyentes. Va el CUIT, la condición frente al IVA y el punto de venta. Si no sabés qué es un punto de venta, está explicado en su propia guía: es un alta que se hace en ARCA, no acá.
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Cargar la credencial

El certificado y la clave privada que ARCA te entrega. Emissa los guarda cifrados y los usa para firmar cada pedido al organismo.La credencial es por contribuyente y por ambiente, así que el certificado de prueba y el productivo son dos credenciales distintas sobre el mismo CUIT.
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Verificar la conexión

Hay un botón que le pregunta a ARCA si todo está en orden antes de que emitas. Conviene usarlo: es la diferencia entre enterarte ahora o enterarte con un cliente esperando la factura.

Las tres zonas del panel

La barra lateral está agrupada, y el orden no es alfabético: primero lo que se hace todos los días, después lo que se toca al integrar, y al final lo que se configura una sola vez.
Si facturás a mano, tu panel es la zona de Operación más Contribuyentes. Todo lo demás se puede ignorar sin perderse nada. La zona de Integración sólo hace falta cuando querés que otro sistema emita por vos, y eso está contado en su guía.

Emitir un comprobante

Es el camino que más vas a recorrer, así que conviene conocer sus tres particularidades.
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Elegí el contribuyente que emite

Si tenés varios CUIT cargados, el panel siempre muestra cuál está activo. No hay forma de emitir “sin querer” desde el equivocado.
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Cargá el receptor

Es tu cliente. El documento se valida antes de hablar con ARCA: un CUIT mal tipeado se detecta acá, y eso es gratis. Detectado del otro lado, ya consumió número de comprobante.
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Cargá los ítems

Descripción, cantidad y precio. Los totales los calcula el panel; no hace falta que cierren a mano.
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Confirmá

Antes de mandar nada, el panel muestra qué va a emitir. La letra del comprobante —A, B o C— no se elige: sale de tu condición frente al IVA y la de tu cliente. Está explicado en por qué hay comprobantes A, B y C.

El comprobante puede terminar de cuatro maneras

Y conviene reconocerlas, porque dos de las cuatro no son un error de Emissa y se resuelven distinto.
«Sin resolver» es el que no hay que reintentar a ciegas. Quiere decir que no se sabe si ARCA autorizó o no. Volver a emitir puede generar un segundo comprobante fiscal por la misma venta, y eso ya no se borra: se revierte con una nota de crédito.El panel tiene un botón para resolverlo, que le pregunta al organismo qué pasó de verdad. Ése es el camino. El detalle completo está en qué hacer cuando el CAE viene rechazado.

Consultar lo que ya emitiste

En Comprobantes. Se puede filtrar y, de cada uno, descargar el PDF —A4 o ticket, los dos con el QR que exige la RG 4892—.
Lo que ya facturaste es tuyo. Consultar comprobantes y descargar sus PDF sigue funcionando incluso si la cuenta queda suspendida por falta de pago: es evidencia de tu cliente, no una función que se apaga.

Anular

Una factura emitida no se borra: se revierte con una nota de crédito, que es otro comprobante, con su propio número y su propio CAE. El panel la genera y la asocia sola a la original.
Por eso una anulación también cuenta para tu consumo del mes: es un comprobante más. Ver cómo se te cobra.

Clientes

Para no volver a tipear los datos del mismo receptor cada vez. Es una comodidad, no un requisito: se puede emitir sin haber guardado a nadie.

Lo que se configura una vez

Los datos fiscales de Facturación son los que salen impresos en el comprobante que Emissa te emite a vos. Corregirlos después de emitido significa una nota de crédito, así que conviene revisarlos antes del primer cobro.

Qué sigue

Cómo se te cobra

El ciclo del día 1 y los dos caminos de pago.

Cuando el CAE viene rechazado

Los cuatro desenlaces, ejecutados contra ARCA.